En esta nueva versión llega Salmon Run, un nuevo modo de cooperación para cuatro jugadores.
Al hacer equipo con tus amigos, los jugadores pueden participar en la ocupación a tiempo parcial batallando contra la nueva especie Salmónida que, según los Laboratorios de Investigación de Cefalópodos, es aún más letal que la Octariana.
Cuando un jugador cae en el modo cooperación, los compañeros le pueden reanimar dándole tinta en el campo de batalla.